La nématofaune, copilote de la fertilité biologique des sols

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Véritable miroir de la microchaîne alimentaire des sols, l’analyse des communautés de nématodes offre désormais un diagnostic opérationnel pour évaluer la fertilité
et la résilience d’une parcelle, permettant aux agriculteurs de piloter le compromis entre fertilité biologique, santé des cultures et résilience de leur système de culture. La nématofaune, copilote de la fertilité biologique des sols

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Vers microscopiques omniprésents sous nos pieds, les nématodes ne se limitent plus à leur seule réputation de ravageurs des cultures. En réalité, le sol est peuplé d’une multitude de nématodes bénéfiques : ces alliés précieux ne parasitent pas les plantes et sont indispensables au bon fonctionnement biologique des sols. ©Elisol Environnement

Le prélèvement de terre pour l’analyse de la nématofaune se réalise à la tarière dans la strate de sol de 0 à 20 cm de profondeur. 500 g de sol frais sont utilisés pour réaliser l’extraction des nématodes. L’échantillon doit être traité rapi-dement car les nématodes sont extraits vivants, permettant l’étude de l’activité biologique réelle du sol. ©Elisol Environnement

A des « ennemis », c’est réa-todes, ce n’est pas seulement compter nalyser les commu-nautés de néma-	de premier ordre : là où il	global du sol et renseigne	trophique, les nématodes
	y a du sol, il y a des néma-	sur les fonctions qu’il assure.	prédateurs sont des indi-
	todes, et leur communauté	En effet, la nématofaune	cateurs de la stabilité du
	raconte fidèlement son	(l’ensemble des nématodes	milieu. Sensibles aux per-
	histoire. Contrairement aux	du sol) se divise en plusieurs	turbations physiques (labour)
liser un véritable audit de	vers de terre, mobiles et	groupes trophiques qui	ou chimiques (pollutions),
fonctionnement du sol pour	saisonniers, les nématodes	renseignent chacun sur une	leur présence témoigne
ajuster ses pratiques, avec une	présentent une stabilité de	fonction précise du sol :	d’un sol résilient capable de
rigueur scientifique jusqu’ici	population et une fidélité	- Fertilité biologique : les	s’autoréguler.
réservée aux laboratoires de	spatiale qui renforcent la	nématodes bactérivores et	- Pression parasitaire : les
recherche.	fiabilité des diagnostics.	fongivores sont les régulateurs	nématodes phytophages
Les nématodes sont les	Ils ne sont pas de simples	du compartiment microbien.	(consommant des racines
organismes pluricellulaires	acteurs du sol ; ils sont le	En se nourrissant de bacté-	vivantes) renseignent sur
les plus abondants sur	reflet du fonctionnement	ries et de champignons, ils	l’état de la couverture vé-
terre avec en moyenne plus	biologique du sol dans son	stimulent le métabolisme	gétale et le risque de perte
d’un million d’individus par	ensemble.	microbien. Ils informent	de rendement.
mètre carré dans les vingt	CE QUE LES NÉMATODES	sur l’intensité des flux de	Le prélèvement de sol pour
premiers centimètres de sol.		nutriments et la voie de	une analyse de la nématofaune
Leur ubiquité et leur position	RÉVÈLENT DES SOLS	décomposition de la matière	est simple : il est réalisé avec
centrale dans la microchaîne	Parce qu’ils occupent tous	organique majoritaire (plutôt	une tarière dans l’horizon
alimentaire des sols (ou mi-	les étages du microréseau	bactérienne ou fongique).	0-20 cm sur un sol frais,
croréseau trophique) en fait	trophique, leur étude permet	- Résilience du sol : situés	ressuyé et non gelé. Environ
des sentinelles écologiques	d’évaluer l’état biologique	au sommet du microréseau	500 g de terre fraîche sont

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s	nécessaires pour l’extraction	LES PHYTOPARASITES : UN RISQUE		que la fertilisation mixte
	des nématodes, tandis que			(organique et minérale)
		À GÉRER AU CAS PAR CAS
	d’autres sous-échantillons			constituent les leviers les plus
	prélevés simultanément	Il est crucial de distinguer		puissants pour augmenter
	peuvent être utilisés pour	les nématodes « libres »		la fertilité biologique d’un
	des analyses complémen-	(bénéfi ques) des nématodes		sol. En stimulant l’activité
	taires (physico-chimique,	« phytoparasites ».		des nématodes bactérivores
	organo-biologique, micro-	Ces derniers exploitent		(+ 113 %) et des fongivores
		des racines vivantes
	biologique…).			(+ 141 %), ces apports favo-
		pour réaliser leur
	Les référentiels d’interpré-			risent des fl ux de nutriments
		cycle biologique. Certains
	tation développés à partir			dynamiques dans les sols.
		sont très spécialisés,
	de larges jeux de données,	comme Heterodera carotae		L’allongement des rotations
	comme ceux de la base	qui ne s’attaque qu’à la		et l’implantation de couverts
	Elipto proposée par Elisol	carotte. D’autres sont		végétaux sont également très
	environnement, permettent	généralistes, comme les		favorables pour soutenir la
		nématodes à galles du
	aujourd’hui de structurer			fertilité biologique.
		genre meloidogyne qui
	des résultats en scores			Pour ce qui est de la diver-
		parasitent des centaines d’espèces. Un sol peut héberger des parasites sans qu’il y ait de dégâts, si la plante en place est résistante ou si le sol	Exemple de symptômes sur les racines liés à la présence du nématode à galle meloidogyne. ©Elisol Environnement
	synthétiques allant de 0			sité des organismes et de
	à 10. Les diagnostics sont			la résilience du sol, le levier
	donc accessibles pour les			majeur est la réduction du
	non-spécialistes. Cette ana-			temps de sol nu. En limitant
	lyse peut être déployée dans			l’érosion et en fournissant
		est « suppressif », un	(nématodes à kystes, à
	une démarche de conseil,			une ressource continue
		mécanisme encore peu	galles, ectoparasites,
	d’expérimentation ou de			aux organismes du sol, les
		expliqué qui limite l’action	endoparasites…), ce qui
	suivi agroécologique d’une			couverts végétaux d’inter-
		des phytoparasites sur	oblige des diagnostics au
	parcelle agricole, mais éga-	les cultures. Cette	cas par cas. Ainsi, le suivi et	culture augmentent de 80 %
	lement de milieux naturels,	« suppressivité » s’observe	l’identifi cation des genres et	l’abondance des nématodes
	industriels ou urbains.	en majorité dans des sols	des espèces de nématodes	prédateurs, renforçant ainsi
	PILOTER LE COMPROMIS	en bon état biologique.	présents dans les sols et les	la stabilité et la structure du
		Il existe une immense	racines des cultures sont
				microréseau trophique du
		diversité d’espèces de	les premiers éléments à
	ENTRE FERTILITÉ ET			sol. La fertilisation organique
		nématodes phytoparasites	partir duquel une stratégie
	DIVERSITÉ			et les rotations longues par-
		avec diverses stratégies	de lutte intégrée pourra
	Un sol peut être biologi-	de parasitisme	être mise en place.	ticipent également à cette
	quement très actif mais	nutriments dépassant les	Il est donc nécessaire d’avoir	dynamique positive.
	fonctionner de manière			Enfi n, l’étude souligne que
	déséquilibrée. Par exemple,			l’utilisation de pesticides
	des apports importants	besoins des cultures, tout	des indicateurs permettant	(dont les nématicides), du
	d’azote sous forme minérale	en perdant sa capacité de	de statuer sur ce compromis	labour conventionnel et de la
	ou un travail profond du sol	régulation naturelle contre	entre fertilité et diversité	fertilisation minérale stricte
	vont favoriser les nématodes	les pathogènes et en géné-	afi n de mettre en place des	sont les pratiques les plus
	bactérivores et donc l’activité	rant des fl ux de CO2 néfastes pour le climat. À l’inverse,	mesures correctives avant que les sols ne soient en	déterminant sur la fertilité
	biologique du sol. Si l’activité			biologique et la diversité des
	des nématodes bactérivores	l’agroécologie cherche les	mauvais état de santé glo-	organismes du sol.
	stimule la minéralisation	pratiques qui permettent	bale. C’est là que l’analyse de	Cette hiérarchisation permet
	à court terme, et donc les	de stabiliser ce réseau et	la nématofaune apporte des	aux agriculteurs d’entrer
	fl ux de nutriments, elle se	de maintenir l’ensemble des	résultats probants.	dans une stratégie de pra-
	fait dans ces situations au	fonctions du sol sur la durée.		tiques compensatoires pour
	détriment de la diversité	Néanmoins le travail du sol	ENSEIGNEMENTS D’UNE	développer des systèmes de
globale, de la structure du	et la fertilisation azotée sont	MÉTA-ANALYSE MONDIALE	culture durables. Par exemple,
réseau trophique et donc	parfois nécessaires pour la	Une méta-analyse réalisée	si un labour du sol est jugé
des autres fonctions du	productivité des cultures,	en 2021 par Puissant et al.,	nécessaire, son impact négatif
sol comme la transformation	mais ces pratiques peuvent	compilant plus de 1 300	sur la résilience du sol et la
du carbone, les régulations	être réalisées avec modération	observations à l’échelle mon-	diversité des organismes
biologiques ou encore la	(c’est-à-dire fractionnement	diale, a permis de quantifi er	peut être compensé par
stabilité structurale du sol. Le	des apports, fréquence du	l’impact des choix tech-	l’implantation d’un couvert
risque ? Un sol qui « brûle »	travail du sol, profondeur)	niques sur la vie du sol. Les	végétal ou un amendement
sa matière organique trop	et surtout être compensées	résultats confi rment que la	organique. L’étude souligne
vite, générant des fl ux de	par d’autres pratiques.	fertilisation organique, ainsi	d’ailleurs un « combo per-

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ELISOL ENVIRONNEMENT : L’EXPERTISE AU SERVICE DE LA TRANSITION ÉCOLOGIQUE											La gestion ne passe plus par le « vide sanitaire » chimique, souvent contre-productif car il favorise le retour rapide des parasites dans un milieu sans prédateurs. La lutte intégrée privilégie désormais des leviers agronomiques et biologiques visant à limiter le développement de ces organismes. Parmi les solutions les plus utilisées fi gurent la rotation des cultures, l’introduction de plantes non-hôtes et l’utilisation de variétés ré-sistantes. Certains couverts végétaux, comme la mou-tarde ou le radis fourrager, possèdent également un effet nématicide grâce à la biofumigation, tandis que les « plantes pièges » limitent leur reproduction. D’autres méthodes, comme la solarisation en maraîchage ou le recours à des agents de biocontrôle (champignons, bactéries, prédateurs natu-rels), complètent ces straté-gies. Enfi n, l’amélioration de la santé du sol constitue un levier essentiel : matière or-ganique, couverture végétale et réduction du travail du sol favorisent la biodiversité et les régulations naturelles. Un sol vivant est généralement plus résistant aux attaques de nématodes phytopara-sites. Camille Chauvin, Elisol environnement CÔTÉ BIBLIO Puissant, J., Villenave, C., Chauvin, C., Plassard, C., Blanchart, E., Trap, J. 2021. Quantifi cation of the global impact of agricultural practices on soil nematodes : A meta-analysis. Soil Biology and Biochemistry 2021.108383. doi : 10.1016/j. soilbio.2021.108383
Elisol environnement est le premier laboratoire français spécialisé dans l’analyse de la nématofaune		Les six scores du fonctionnement biologique d’un sol Votre échantillon
du sol. Installée dans le		État biologique altéré	État biologique limité							Bon état biologique
Gard, cette entreprise innovante s’appuie sur		Niveau d’activité biologique
une équipe d’experts pour		Pression parasitaire		10 8 6 4						Intensité des flux de nutriments
transformer des données
biologiques en outils de
pilotage opérationnels pour les agriculteurs et		2 0
gestionnaires de sols. Le		Voies de décomposition de la matière organique			Stabilité du milieu, assurance écologique
cœur du savoir-faire de
l’entreprise repose sur Elipto,
					Diversité
une base de données unique
					Source : Elisol environnement
qui centralise plus de 10 000
analyses de terre. Cette
base croise les données		surveiller ou satisfaisant) est						scientifi que et technique
biologiques avec le contexte		évalué à partir de six scores :						dans les projets de gestion
pédoclimatique (texture,		activité biologique, intensité						des sols et épaule les
pH, carbone, coordonnées		des fl ux de nutriments,				porteurs de nouvelles
géographiques) et l’usage		assurance écologique, voies						solutions (biostimulants,
du sol pour un système de		de décomposition de la				bionématicides, nouveaux
notation adapté à chaque		matière organique, diversité						types de fertilisants
usage (grandes cultures,		et pression parasitaire.				organiques…) dans
vigne, maraîchage, forêt,		Au-delà de la mesure, Elisol						l’évaluation de leur effi cacité
prairie). Le fonctionnement		environnement assure un					et de leur innocuité pour
biologique d’un sol (altéré, à		véritable accompagnement						l’environnement.
Podium des effets positifs de différentes pratiques sur les paramètres de la nématofaune Fertilité biologique Fertilisation organique et organo-minérale Résilience / diversité des organismes Fertilisation organique Couverts végétaux Rotation Couverts végétaux Rotation Source : Elisol environnement
	dant » pour la santé du	le plus élevé sur l’ensemble							phytoparasites. Les pertes
sol : le labour conventionnel		des indicateurs nématofau-							de rendement liées à ces
suivi d’une période de sol nu		niques. Ces effets positifs							organismes sont estimées
prolongée sous fertilisation		permettent en partie de							à 100 milliards de dollars
minérale stricte, une situation		compenser l’impact négatif							par an dans le monde. En
qui ne favorise ni la résilience		de l’usage de pesticides sur							grandes cultures, ces dégâts
ni la fertilité à long terme.		la santé des sols dans ces							sont souvent sous-estimés
Enfi n, l’agriculture de conser-		systèmes.	car ils se manifestent par des
vation des sols (ACS) addi-		symptômes peu spécifi ques :
tionne les leviers favorables		GÉRER LA MENACE				jaunissements, fl étrissements
(moindre travail du sol, rotation		DES PHYTOPARASITES					ou retards de croissance que
longue, fertilisation mixte) et		Certains nématodes restent							l’on confond souvent avec
montre l’effet positif moyen		des ennemis redoutables : les							des carences azotées.

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Original source: 1782738553603.pdf